МБОУ СОШ № 6 имеет богатую историю, которая восходит к концу XIX века, когда 25 сентября 1895 года в Пятигорске была открыта первая бесплатная школа для девочек.
Помещалась она в частном доме графа генерала Евдокимова, связанном с самым ранним периодом истории города: в те годы только начали застраиваться первые кварталы так называемого «Лермонтовского Пятигорска».
Школа несколько раз перестраивалась, меняла статус: была «мужской», «женской», затем стала школой «смешанной».